2013年初級檢驗技師生化檢驗:蛋白質(zhì)組及分析技術(shù)
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隨著大量生物體全基因組序列的獲得,特別是人類基因組序列草圖的完成,基因組學(xué)研究重點不可避免地從結(jié)構(gòu)基因組學(xué)轉(zhuǎn)向功能基因組學(xué),而蛋白質(zhì)組學(xué)(proteom)正是作為功能基因組研究的重要支柱在上世紀(jì)90年代中期應(yīng)運而生。蛋白質(zhì)組是指一個基因,一個細胞或組織所表達的全部蛋白質(zhì)成分。蛋白質(zhì)組學(xué)研究的是在不同時間和空間發(fā)揮功能的特定蛋白質(zhì)群體,從而揭示和說明生命活動的基本規(guī)律。蛋白質(zhì)組學(xué)可以分為三個領(lǐng)域:①蛋白質(zhì)的大規(guī)模的分離與鑒定,以及它們的表達后修飾;②蛋白水平的差異顯示在疾病中的運用;③運用當(dāng)前的一切手段研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互關(guān)系。與基因組相比蛋白質(zhì)組具有多樣性和可變性。對一個機體而言,基因的數(shù)目是恒定的,而蛋白質(zhì)的種類和數(shù)目在同一個機體的不同細胞中各不相同,即使同一細胞在不同的時期,不同條件下,其蛋白質(zhì)表達也不同。雖然可以通過cDNA芯片等方法顯示生物體的基因啟動狀況,但mRNA水平 (包括mRNA的種類和含量 )并不能完全反映出蛋白質(zhì)的表達。另外從研究手段方面來說,蛋白質(zhì)研究技術(shù)比基因技術(shù)相對要復(fù)雜和困難,不僅氨基酸殘基數(shù)量多于核甘酸殘基,而且在蛋白質(zhì)組研究中沒有一種方法象PCR那樣能迅速擴增目的片段,這樣對于豐度低但功能重要的蛋白質(zhì)很難進行大規(guī)模的研究。
目前,蛋白質(zhì)組學(xué)研究的主要技術(shù)包括:雙向(二維)聚丙烯酰胺凝膠電泳(結(jié)合等電聚焦和IEJK)分離蛋白質(zhì),在固相載體上形成蛋白質(zhì)-多肽圖譜,用敏感的方法染色(如銀染)并用圖像分析電子計算機進行鑒定;將蛋白質(zhì)點切下,用酶消化,進一步用氨基酸分析、質(zhì)譜分析等進行鑒定;或結(jié)合蛋白質(zhì)的毛細管電泳,高效液相色譜技術(shù)(HPLC)以至蛋白質(zhì)芯片進行鑒定。
蛋白質(zhì)芯片 (protein array)是近年來蛋白質(zhì)組學(xué)研究中興起的一種新的方法,它類似于基因芯片,是將蛋白質(zhì)點到固相物質(zhì)上,然后與要檢測的組織或細胞等進行“雜交”,再通過自動化儀器分析得出結(jié)果。這里所指的“雜交”是指蛋白與蛋白之間如 (抗體與抗原 )在空間構(gòu)象上能特異性的相互識別。此方法與傳統(tǒng)的研究方法相比具有如下優(yōu)點:①蛋白質(zhì)芯片是一種高通量的研究方法,能在一次實驗中提供相當(dāng)大的信息量,使我們能夠全面、準(zhǔn)確的研究蛋白表達譜,這是傳統(tǒng)的蛋白研究方法無法做到的。②蛋白質(zhì)組芯片的靈敏度高,它可以檢測出蛋白樣品中微量蛋白的存在,檢測水平已達ng級。美國科學(xué)家Haab等運用綠色熒光 (green fluorescence)標(biāo)記抗體微陣列,用紅色熒光 (red fluorecence)標(biāo)記蛋白混和物,并運用計算機識別 (R/G)的信號強弱,來進行檢測,檢測水平可達到 1ng/ml。③蛋白質(zhì)芯片具有高度的準(zhǔn)確性。
蛋白質(zhì)組芯片可用于蛋白質(zhì)組學(xué)研究中的各個領(lǐng)域,具體來說大致可分為三個方面:研究蛋白質(zhì)與蛋白質(zhì)之間的相互作用,篩選新的蛋白質(zhì);蛋白質(zhì)芯片能夠用于現(xiàn)在其它方法不能檢測到的,如蛋白質(zhì)-藥物、蛋白質(zhì)-脂質(zhì)之間的相互作用;蛋白質(zhì)組芯片還可用于檢測蛋白與小分子物質(zhì)的作用。例如蛋白質(zhì)與DNA ,RNA分子等。蛋白質(zhì)芯片的制作是決定其運用的關(guān)鍵因素之一,蛋白質(zhì)組芯片的制作比當(dāng)前流行DNA芯片制作要復(fù)雜,特別是涉及大量不同種類的蛋白的高效表達與純化。因此,蛋白質(zhì)芯片制作存在費時、費力且成本較高等不足,限制了其在臨床的應(yīng)用。
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