臨床執(zhí)業(yè)助理醫(yī)師考試生物化學(xué)輔導(dǎo)：DNA結(jié)合蛋白

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　　結(jié)構(gòu)蛋白可與DNA結(jié)合，是非專一性DNA-蛋白質(zhì)交互作用的常見(jiàn)例子。染色體中的結(jié)構(gòu)蛋白與DNA組合成復(fù)合物，使DNA組織成緊密結(jié)實(shí)的染色質(zhì)構(gòu)造。對(duì)真核生物來(lái)說(shuō)，染色質(zhì)是由DNA與一種稱為組織蛋白的小型堿性蛋白質(zhì)所組合而成;而原核生物體內(nèi)的此種結(jié)構(gòu)，則摻雜了多種類型的蛋白質(zhì)。雙股 DNA可在組織蛋白的表面上附著并纏繞整整兩圈，以形成一種稱為核小體的盤(pán)狀復(fù)合物。組織蛋白里的堿性殘基，與DNA上的酸性糖磷酸骨架之間可形成離子鍵，使兩者發(fā)生非專一性交互作用，也使復(fù)合物中的堿基序列相互分離。在堿性氨基酸殘基上所發(fā)生的化學(xué)修飾有甲基化、磷酸化與乙?；?，這些化學(xué)作用可使 DNA與組織蛋白之間的作用強(qiáng)度發(fā)生變化，進(jìn)而使DNA與轉(zhuǎn)錄因子接觸的難易度改變，影響轉(zhuǎn)錄作用的速率。其他位于染色體內(nèi)的非專一性DNA結(jié)合蛋白，還包括一種能優(yōu)先與DNA結(jié)合，并使其扭曲的高移動(dòng)性群蛋白。這類蛋白質(zhì)可以改變核小體的排列方式，產(chǎn)生更復(fù)雜的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)。

　　DNA結(jié)合蛋白中有一種專門(mén)與單股DNA結(jié)合的類型，稱為單股DNA結(jié)合蛋白。人類的復(fù)制蛋白A是此類蛋白中獲得較多研究的成員，作用于多數(shù)與解開(kāi)雙螺旋有關(guān)的過(guò)程，包括DNA復(fù)制、重組以及DNA修復(fù)。這類結(jié)合蛋白可固定單股DNA，使其變得較為穩(wěn)定，以避免形成莖環(huán)(stem-loop)，或是因?yàn)楹怂崦傅淖饔枚狻?/P>

　　λ抑制子是一類具螺旋-轉(zhuǎn)角-螺旋結(jié)構(gòu)的轉(zhuǎn)錄因子，可與DNA目標(biāo)結(jié)合。相對(duì)而言，其他的蛋白質(zhì)則只能與特定的DNA序列進(jìn)行專一性結(jié)合。大多數(shù)關(guān)于此類蛋白質(zhì)的研究集中于各種可調(diào)控轉(zhuǎn)錄作用的轉(zhuǎn)錄因子。這類蛋白質(zhì)中的每一種，都能與特定的DNA序列結(jié)合，進(jìn)而活化或抑制位于啟動(dòng)子附近序列的基因轉(zhuǎn)錄作用。轉(zhuǎn)錄因子有兩種作用方式，第一種可以直接或經(jīng)由其他中介蛋白質(zhì)的作用，而與負(fù)責(zé)轉(zhuǎn)錄的RNA聚合酶結(jié)合，再使聚合酶與啟動(dòng)子結(jié)合，并開(kāi)啟轉(zhuǎn)錄作用。第二種則與專門(mén)修飾組織蛋白的酵素結(jié)合于啟動(dòng)子上，使DNA模板與聚合酶發(fā)生接觸的難度改變。

　　由于目標(biāo)DNA 可能散布在生物體中的整個(gè)基因組中，因此改變一種轉(zhuǎn)錄因子的活性可能會(huì)影響許多基因的運(yùn)作[101].這些轉(zhuǎn)錄因子也因此經(jīng)常成為信號(hào)傳遞過(guò)程中的作用目標(biāo)，也就是作為細(xì)胞反映環(huán)境改變，或是進(jìn)行分化和發(fā)育時(shí)的媒介。具專一性的轉(zhuǎn)錄因子會(huì)與DNA發(fā)生交互作用，使DNA堿基的周圍產(chǎn)生許多接觸點(diǎn)，讓其他蛋白質(zhì)得以“讀取”這些DNA序列。多數(shù)的堿基交互作用發(fā)生在大凹槽，也就是最容易從外界接觸堿基的部位。

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